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chr1	157910173	157911099	304	*	Distal Intergenic	922	ENST00000484609.1	-11917	CD5L	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0002376,GO:0004252,GO:0005044,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006897,GO:0006915,GO:0006954,GO:0006968,GO:0009986,GO:0030449,GO:0031638,GO:0072562,GO:1903661	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr1	167208583	167210277	349	*	Distal Intergenic	5451	ENST00000559038.5	-10599	POU2F1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000979,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005783,GO:0006357,GO:0019221,GO:0042795,GO:0043231,GO:0043565,GO:0045892,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045944,GO:0090575	hsa05168,hsa05417	NA	GSE161529	33950524
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chr10	15927569	15927934	326	*	Distal Intergenic	80013	ENST00000277632.8	-67062	MINDY3	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0004843,GO:0005515,GO:0005654,GO:0006915,GO:0008234,GO:0018215,GO:0031965,GO:0071108,GO:1990380,GO:1990380	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr10	123127725	123128738	449	*	Distal Intergenic	340784	ENST00000357878.7	-7232	HMX3	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007420,GO:0007566,GO:0030154,GO:0042472,GO:0050885,GO:0060135	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr10	130243787	130244713	762	*	Intron (ENST00000648275.1/107984002, intron 1 of 1)	107984002	ENST00000648275.1	30260	LINC02646	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	130447956	130448460	285	*	Intron (ENST00000648275.1/107984002, intron 1 of 1)	107984002	ENST00000648275.1	234429	LINC02646	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	130502823	130504335	304	*	Distal Intergenic	107984002	ENST00000648275.1	289296	LINC02646	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	130602051	130603149	351	*	Distal Intergenic	100422867	ENST00000578683.1	359519	MIR378C	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:1903561	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	130629962	130630362	335	*	Distal Intergenic	100422867	ENST00000578683.1	332306	MIR378C	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:1903561	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	131107920	131109362	593	*	Intron (ENST00000483040.1/256536, intron 9 of 11)	101927489	ENST00000436942.1	12702	TCERG1L-AS1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	131365582	131366234	351	*	Distal Intergenic	256536	ENST00000368642.4	-53861	TCERG1L	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003712,GO:0005634,GO:0006355,GO:0070063	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	131563630	131564422	597	*	Distal Intergenic	399827	ENST00000684956.2	212980	LINC01164	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	131678683	131679839	1157	*	Distal Intergenic	399827	ENST00000684956.2	97563	LINC01164	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	131708622	131709284	270	*	Distal Intergenic	399827	ENST00000684956.2	68118	LINC01164	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	131732088	131734062	269	*	Distal Intergenic	399827	ENST00000684956.2	43340	LINC01164	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	131760632	131761107	347	*	Distal Intergenic	399827	ENST00000684956.2	16295	LINC01164	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	132806600	132807058	453	*	Distal Intergenic	84504	ENST00000368592.8	-20453	NKX6-2	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000122,GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0010454,GO:0010455,GO:0022010,GO:0030154,GO:0031018,GO:0031641,GO:0045686,GO:0045687,GO:0045892,GO:0050885,GO:1990837	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	132840982	132843604	1779	*	Intron (ENST00000368586.10/54777, intron 44 of 57)	54777	ENST00000476633.1	-3905	CFAP46	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005930,GO:0035082,GO:0060294	NA	NA	GSE161529	33950524
chr10	133547892	133548470	295	*	Intron (ENST00000368520.1/1571, intron 5 of 5)	1571	ENST00000469258.1	10392	CYP2E1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000139,GO:0002933,GO:0004497,GO:0004497,GO:0005506,GO:0005737,GO:0005743,GO:0005789,GO:0006082,GO:0006641,GO:0006805,GO:0006805,GO:0008202,GO:0008392,GO:0008395,GO:0009617,GO:0010193,GO:0010243,GO:0016098,GO:0016491,GO:0016709,GO:0016712,GO:0017144,GO:0017144,GO:0017144,GO:0018601,GO:0018885,GO:0018910,GO:0018960,GO:0019373,GO:0019825,GO:0019899,GO:0020037,GO:0020037,GO:0030544,GO:0031227,GO:0042197,GO:0042738,GO:0042759,GO:0043231,GO:0045471,GO:0046483,GO:0051879,GO:0070330	hsa00140,hsa00590,hsa00591,hsa00980,hsa00982,hsa00983,hsa01100,hsa04932,hsa05204	NA	GSE161529	33950524
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chr11	2485648	2486431	293	*	Intron (ENST00000496887.6/3784, intron 2 of 6)	3784	ENST00000380776.4	23761	KCNQ1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005249,GO:0005249,GO:0005249,GO:0005251,GO:0005251,GO:0005251,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005516,GO:0005546,GO:0005737,GO:0005764,GO:0005769,GO:0005769,GO:0005770,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0005886,GO:0006349,GO:0007605,GO:0008016,GO:0008076,GO:0008076,GO:0008076,GO:0008157,GO:0010460,GO:0015271,GO:0015271,GO:0016021,GO:0016323,GO:0016458,GO:0030659,GO:0034236,GO:0034237,GO:0034702,GO:0035690,GO:0044325,GO:0045121,GO:0048839,GO:0050892,GO:0060048,GO:0060306,GO:0060306,GO:0060307,GO:0060372,GO:0060452,GO:0060453,GO:0061337,GO:0070293,GO:0071320,GO:0071320,GO:0071805,GO:0071805,GO:0071872,GO:0072359,GO:0086005,GO:0086008,GO:0086011,GO:0086013,GO:0086013,GO:0086014,GO:0086089,GO:0086089,GO:0086091,GO:0097110,GO:0097623,GO:0097623,GO:0098914,GO:0098915,GO:0098915,GO:1901381,GO:1902282,GO:1902282	hsa04261,hsa04725,hsa04971,hsa04972,hsa04974,hsa05110	NA	GSE161529	33950524
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chr11	17623112	17623578	293	*	Intron (ENST00000399397.6/340990, intron 39 of 55)	340990	ENST00000342528.2	44848	OTOG	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005198,GO:0005615,GO:0005829,GO:0007605,GO:0008344,GO:0016324,GO:0031012,GO:0046373,GO:0046556	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr11	33798169	33798762	415	*	Distal Intergenic	105376619	ENST00000534666.1	-6006	LINC02722	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr11	43300708	43301623	514	*	Distal Intergenic	8539	ENST00000534695.5	-10340	API5	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003723,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005681,GO:0005737,GO:0006915,GO:0016020,GO:0016607,GO:0017134,GO:0043066,GO:0043066,GO:0043066,GO:0043066,GO:2000270	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr11	75429284	75429908	496	*	Promoter (<=1kb)	283212	ENST00000460787.1	154	KLHL35	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515	NA	NA	GSE161529	33950524
chr11	75684471	75685220	269	*	Distal Intergenic	4135	ENST00000304771.8	-15433	MAP6	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000226,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005798,GO:0005801,GO:0005874,GO:0005874,GO:0008017,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030658,GO:0030705,GO:0032418,GO:0048471,GO:0048813,GO:0048813,GO:0050772,GO:0070507	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr11	116713203	116713572	285	*	Distal Intergenic	84811	ENST00000419189.1	49264	BUD13	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000398,GO:0000398,GO:0000398,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005684,GO:0070274,GO:0070274,GO:0071005	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr11	131540339	131541359	623	*	Promoter (<=1kb)	101929653	ENST00000443319.2	0	LOC101929653	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr11	132250728	132251483	558	*	Intron (ENST00000374791.7/50863, intron 4 of 7)	100874281	ENST00000421651.1	-32819	NTM-IT	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr11	133486812	133487240	413	*	Intron (ENST00000524381.6/4978, intron 1 of 7)	4978	ENST00000529038.5	45162	OPCML	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr11	134830397	134830939	284	*	Distal Intergenic	729305	ENST00000513405.1	94801	LINC02714	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr12	34356583	34389637	357	*	Distal Intergenic	84920	ENST00000266483.7	334087	ALG10	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0106073	hsa00510,hsa01100	NA	GSE161529	33950524
chr12	34356583	34389637	320	*	Distal Intergenic	84920	ENST00000266483.7	334087	ALG10	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0106073	hsa00510,hsa01100	NA	GSE161529	33950524
chr12	34356583	34389637	334	*	Distal Intergenic	84920	ENST00000266483.7	334087	ALG10	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0106073	hsa00510,hsa01100	NA	GSE161529	33950524
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chr13	27370407	27370789	355	*	Distal Intergenic	2971	ENST00000381140.10	-53830	GTF3A	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003677,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0006383,GO:0008097,GO:0009303,GO:0042273,GO:0046872	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr13	27946220	27947848	383	*	Distal Intergenic	100132234	ENST00000567234.1	-5678	LINC00543	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	51117231	51118181	806	*	Intron (ENST00000636098.1/647166, intron 1 of 4)	647166	ENST00000563710.7	-5957	C13orf42	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	53516097	53516652	269	*	Intron (ENST00000657016.1/ENST00000657016.1, intron 2 of 3)	100861552	ENST00000569422.1	-298767	LINC00558	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	54630402	54630833	372	*	Intron (ENST00000663979.1/ENST00000663979.1, intron 2 of 2)	100302187	ENST00000637311.1	-318354	MIR1297	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	56012766	56013038	269	*	Distal Intergenic	100846996	ENST00000583098.1	838312	MIR5007	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	108662444	108663440	270	*	Intron (ENST00000356711.7/23026, intron 1 of 34)	23026	ENST00000457511.7	32833	MYO16	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003774,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005886,GO:0008285,GO:0014065,GO:0016459,GO:0019903,GO:0021549,GO:0048471,GO:0048471,GO:0048812,GO:0051015,GO:0051015,GO:2000134,GO:2000134	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	111106967	111107510	326	*	Intron (ENST00000664746.1/ENST00000664746.1, intron 1 of 1)	8874	ENST00000483540.1	-7049	ARHGEF7	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001726,GO:0005085,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005925,GO:0005938,GO:0007030,GO:0007165,GO:0007186,GO:0007399,GO:0010763,GO:0019901,GO:0030027,GO:0030032,GO:0032991,GO:0035556,GO:0042059,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043065,GO:0043065,GO:0043547,GO:0043547,GO:0048013,GO:0048041,GO:0051056,GO:1900026,GO:1904424,GO:2000394	hsa04810,hsa05135	NA	GSE161529	33950524
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chr13	111568544	111569402	399	*	Distal Intergenic	102724489	ENST00000375713.1	-18889	LOC102724489	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	111572923	111575800	466	*	Distal Intergenic	102724489	ENST00000375713.1	-12491	LOC102724489	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	111586326	111586741	300	*	Promoter (1-2kb)	102724489	ENST00000375713.1	-1550	LOC102724489	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	111662367	111662824	458	*	Intron (ENST00000375713.1/102724489, intron 3 of 3)	105370369	ENST00000401043.3	66358	LINC02337	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr13	111867419	111869965	1050	*	Intron (ENST00000663211.1/101928616, intron 1 of 1)	101928616	ENST00000663211.1	2283	LINC00354	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	111897152	111897718	567	*	Promoter (2-3kb)	101928616	ENST00000440860.1	-2267	LINC00354	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	111936101	111936641	359	*	Distal Intergenic	101928616	ENST00000664504.1	36113	LINC00354	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr13	112006339	112007054	273	*	Distal Intergenic	100505996	ENST00000663025.1	-49791	SOX1-OT	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr14	29438016	29438334	300	*	Intron (ENST00000652296.1/ENST00000652296.1, intron 3 of 4)	102724934	ENST00000652703.1	-45968	LOC102724934	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr14	36610023	36610653	405	*	Intron (ENST00000634305.1/ENST00000634305.1, intron 3 of 3)	26257	ENST00000258829.6	-27409	NKX2-8	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001889,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005634,GO:0006351,GO:0006357,GO:0006366,GO:0007409,GO:0030154,GO:0030324,GO:0043565,GO:0045944,GO:0050680,GO:1990837	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr14	37635357	37635729	373	*	Intron (ENST00000553443.6/319089, intron 3 of 32)	319089	ENST00000533625.5	24106	TTC6	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr14	57877738	57878382	269	*	Intron (ENST00000556568.1/341880, intron 1 of 1)	341880	ENST00000556826.6	-11646	SLC35F4	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0016021,GO:0022857,GO:0055085	NA	NA	GSE161529	33950524
chr14	57950757	57952514	299	*	Intron (ENST00000556568.1/341880, intron 1 of 1)	341880	ENST00000554648.1	29549	SLC35F4	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0016021,GO:0022857,GO:0055085	NA	NA	GSE161529	33950524
chr14	60497336	60498157	799	*	Intron (ENST00000556799.1/317761, intron 2 of 5)	4990	ENST00000327720.6	-10989	SIX6	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001654,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357,GO:0007601,GO:0009887,GO:1990837	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr14	97109067	97110372	850	*	Distal Intergenic	105370648	ENST00000554445.1	-44485	LINC02304	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr14	104468127	104468594	405	*	Distal Intergenic	400258	ENST00000331952.6	-111170	C14orf180	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005886,GO:0016021	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr14	105776434	105777052	418	*	Distal Intergenic	100616374	ENST00000579784.1	80520	MIR4539	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr14	105812229	105812640	356	*	Distal Intergenic	100616374	ENST00000579784.1	44932	MIR4539	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr14	105828629	105829574	269	*	Distal Intergenic	100616374	ENST00000579784.1	27998	MIR4539	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr14	106073197	106073686	488	*	Distal Intergenic	8755	ENST00000606026.2	-100928	ADAM6	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr14	106384882	106385574	462	*	Distal Intergenic	338005	ENST00000603633.3	-96861	LINC00221	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr15	22300250	22300574	303	*	Distal Intergenic	646396	ENST00000556034.1	21279	REREP3	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr15	24775739	24777019	1035	*	Intron (ENST00000651136.1/791114, intron 9 of 14)	6638	ENST00000400098.6	-46618	SNRPN	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000398,GO:0000398,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005681,GO:0005682,GO:0005685,GO:0005686,GO:0005687,GO:0005737,GO:0008380,GO:0009725,GO:0030532,GO:0046540,GO:0071004,GO:0071013	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr15	59981233	59981751	496	*	Distal Intergenic	27023	ENST00000560857.1	-22483	FOXB1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001655,GO:0001756,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007412,GO:0007595,GO:0008542,GO:0009653,GO:0021510,GO:0021767,GO:0021794,GO:0021855,GO:0022029,GO:0030154,GO:0030901,GO:0033504,GO:0043524,GO:0043565,GO:0061030,GO:0061374,GO:0061377,GO:0061379,GO:0061381,GO:1990837	NA	NA	GSE161529	33950524
chr15	59981849	59984060	431	*	Distal Intergenic	27023	ENST00000560857.1	-20174	FOXB1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001655,GO:0001756,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007412,GO:0007595,GO:0008542,GO:0009653,GO:0021510,GO:0021767,GO:0021794,GO:0021855,GO:0022029,GO:0030154,GO:0030901,GO:0033504,GO:0043524,GO:0043565,GO:0061030,GO:0061374,GO:0061377,GO:0061379,GO:0061381,GO:1990837	NA	NA	GSE161529	33950524
chr15	66034419	66034851	402	*	Intron (ENST00000409699.6/84465, intron 5 of 22)	100422905	ENST00000580794.1	-5382	MIR4311	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr15	79042029	79043895	331	*	Intron (ENST00000558480.7/5923, intron 5 of 26)	5923	ENST00000560334.5	20768	RASGRF1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000165,GO:0005085,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007165,GO:0007264,GO:0007616,GO:0008283,GO:0030426,GO:0031175,GO:0034976,GO:0035020,GO:0035023,GO:0035254,GO:0043005,GO:0043547,GO:0046578,GO:0046579,GO:0046579,GO:0048167,GO:0048168,GO:0090630,GO:2000310	hsa04010,hsa04014,hsa04510	NA	GSE161529	33950524
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chr15	91194873	91195219	332	*	Intron (ENST00000545111.6/9899, intron 1 of 11)	9899	ENST00000330276.4	-30651	SV2B	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001669,GO:0005515,GO:0005886,GO:0006836,GO:0007268,GO:0008021,GO:0008021,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0030672,GO:0030672,GO:0043005,GO:0055085	hsa04512	NA	GSE161529	33950524
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chr15	96886389	96886786	305	*	Distal Intergenic	145946	ENST00000560327.1	102902	SPATA8	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515	NA	NA	GSE161529	33950524
chr15	97173354	97173920	567	*	Distal Intergenic	107984764	ENST00000559321.2	-41892	LINC02253	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	1147054	1147557	411	*	Distal Intergenic	8912	ENST00000348261.11	-5549	CACNA1H	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001518,GO:0005244,GO:0005248,GO:0005515,GO:0005887,GO:0005891,GO:0006936,GO:0007517,GO:0007520,GO:0008016,GO:0008332,GO:0008332,GO:0016021,GO:0019228,GO:0032342,GO:0032870,GO:0034651,GO:0034765,GO:0035725,GO:0035865,GO:0042391,GO:0043005,GO:0045956,GO:0046872,GO:0070509,GO:0070509,GO:0070588,GO:0086010,GO:0097110,GO:0098662,GO:2000344	hsa04010,hsa04020,hsa04713,hsa04925,hsa04927,hsa04929,hsa04934	NA	GSE161529	33950524
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chr16	5179493	5180297	571	*	Intron (ENST00000650622.1/105371067, intron 1 of 3)	105371066	ENST00000566684.2	40546	LINC02164	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	7140879	7141732	287	*	Intron (ENST00000641259.1/54715, intron 7 of 19)	54715	ENST00000674626.1	-161550	RBFOX1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000381,GO:0003723,GO:0003729,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005802,GO:0006397,GO:0007399,GO:0008022,GO:0008380,GO:0010494,GO:0050658,GO:0097165	NA	NA	GSE161529	33950524
chr16	8250041	8250406	294	*	Distal Intergenic	105371070	ENST00000654046.1	-137285	LOC105371070	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	13727216	13728725	269	*	Distal Intergenic	2072	ENST00000682617.1	-191413	ERCC4	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000014,GO:0000109,GO:0000110,GO:0000110,GO:0000712,GO:0000723,GO:0000723,GO:0000724,GO:0000724,GO:0000781,GO:0001094,GO:0003677,GO:0003684,GO:0003684,GO:0003697,GO:0003697,GO:0004520,GO:0004520,GO:0004520,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006281,GO:0006281,GO:0006283,GO:0006289,GO:0006289,GO:0006293,GO:0006295,GO:0006295,GO:0006296,GO:0006296,GO:0006296,GO:0006303,GO:0008022,GO:0009411,GO:0009650,GO:0010506,GO:0010521,GO:0032205,GO:0033683,GO:0033683,GO:0034644,GO:0036297,GO:0042802,GO:0047485,GO:0051974,GO:0061819,GO:0070522,GO:0070911,GO:1901255,GO:1904357,GO:1905765,GO:1905768,GO:1990599,GO:1990841	hsa03420,hsa03460	NA	GSE161529	33950524
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chr16	20125647	20126737	473	*	Distal Intergenic	124274	ENST00000570682.2	-51757	GPR139	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005886,GO:0007186,GO:0007200,GO:0007218,GO:0008188,GO:0016021,GO:0042802	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	27443992	27445554	546	*	Promoter (1-2kb)	50615	ENST00000564583.1	25	IL21R	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001532,GO:0004888,GO:0004896,GO:0005515,GO:0005886,GO:0016021,GO:0030101,GO:0038114	hsa04060,hsa04630,hsa04659,hsa05321	NA	GSE161529	33950524
chr16	31374701	31375502	328	*	Intron (ENST00000268296.9/3687, intron 20 of 29)	3687	ENST00000562138.1	3227	ITGAX	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005178,GO:0005515,GO:0005886,GO:0007155,GO:0007229,GO:0008284,GO:0008305,GO:0009887,GO:0009986,GO:0009986,GO:0009986,GO:0010628,GO:0010628,GO:0016020,GO:0019221,GO:0030198,GO:0030335,GO:0030667,GO:0030971,GO:0031643,GO:0034113,GO:0034689,GO:0038023,GO:0043312,GO:0045766,GO:0046872,GO:0050900,GO:0070821,GO:0101003,GO:1905956	hsa04610,hsa04810,hsa05152	NA	GSE161529	33950524
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chr16	34049885	34051726	738	*	Exon (ENST00000566112.2/ENST00000566112.2, exon 1 of 1)	105369183	ENST00000561642.1	-73539	LOC105369183	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	35352265	35353168	284	*	Exon (ENST00000565394.1/ENST00000565394.1, exon 1 of 1)	283914	ENST00000561756.5	-10244	LINC01566	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	62300353	62301374	490	*	Distal Intergenic	1006	ENST00000584506.1	-263318	CDH8	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000902,GO:0005509,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005912,GO:0007043,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007275,GO:0009409,GO:0016021,GO:0016339,GO:0016342,GO:0034332,GO:0034332,GO:0035249,GO:0042802,GO:0043083,GO:0043679,GO:0045296,GO:0050807,GO:0097060,GO:0098742,GO:0098978	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	86164485	86166219	527	*	Distal Intergenic	100506542	ENST00000669926.2	-29735	LINC01082	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr16	86420707	86423464	372	*	Distal Intergenic	400550	ENST00000600553.5	67417	FENDRR	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr16	86600902	86601256	269	*	Distal Intergenic	2300	ENST00000320241.5	22353	FOXL1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007275,GO:0007495,GO:0007507,GO:0008301,GO:0009653,GO:0030111,GO:0030154,GO:0030166,GO:0043565,GO:0061146	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr17	3362645	3363100	269	*	Intron (ENST00000573491.5/4995, intron 2 of 4)	9596	ENST00000572493.2	-22830	OR1R1P	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr17	5605331	5605967	269	*	Exon (ENST00000699639.1/ENST00000699639.1, exon 2 of 2)	22861	ENST00000572143.2	13457	NLRP1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006915,GO:0006919,GO:0006919,GO:0006919,GO:0006954,GO:0008656,GO:0016032,GO:0019899,GO:0019904,GO:0032495,GO:0032731,GO:0042742,GO:0042981,GO:0050727,GO:0051402,GO:0051607,GO:0061702,GO:0070269,GO:0072558,GO:0072558,GO:0097264,GO:0140374,GO:1904784	hsa04621	NA	GSE161529	33950524
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chr17	8931312	8932480	743	*	Intron (ENST00000269300.8/23533, intron 1 of 17)	23533	ENST00000581552.5	-18795	PIK3R5	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005942,GO:0005944,GO:0006661,GO:0007186,GO:0007186,GO:0014065,GO:0014068,GO:0016020,GO:0030168,GO:0031683,GO:0034451,GO:0043406,GO:0043406,GO:0043551,GO:0046935,GO:0051897	hsa04022,hsa04062,hsa04072,hsa04151,hsa04261,hsa04371,hsa04611,hsa04725,hsa04921,hsa05145,hsa05167	NA	GSE161529	33950524
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chr17	14849007	14849730	671	*	Intron (ENST00000660746.1/107984977, intron 3 of 3)	107984977	ENST00000664152.1	14402	LINC02096	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr17	15116395	15116828	411	*	Distal Intergenic	94151	ENST00000579752.1	-10208	CDRT8	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr17	33526900	33527919	269	*	Intron (ENST00000359872.6/40, intron 1 of 9)	100506677	ENST00000579745.1	5841	AA06	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr17	35482840	35483338	292	*	Intron (ENST00000260908.13/100506736, intron 1 of 3)	100506736	ENST00000587436.1	-4371	SLFN12L	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0016021	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr17	48981863	48982259	397	*	Distal Intergenic	2695	ENST00000357424.2	-13267	GIP	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005179,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005788,GO:0007165,GO:0007186,GO:0007565,GO:0007613,GO:0008344,GO:0009749,GO:0010269,GO:0010447,GO:0010828,GO:0014070,GO:0019233,GO:0031018,GO:0031769,GO:0032024,GO:0033993,GO:0034774,GO:0035640,GO:0042304,GO:0042493,GO:0042594,GO:0043025,GO:0043200,GO:0043434,GO:0043950,GO:0048678,GO:0050796,GO:0055123,GO:0060291,GO:0070094,GO:0070328	hsa04024,hsa04080,hsa04911	NA	GSE161529	33950524
chr17	49170846	49171170	296	*	3' UTR	2793	ENST00000503070.5	37742	GNGT2	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003924,GO:0003924,GO:0005834,GO:0005834,GO:0005834,GO:0005886,GO:0007186,GO:0007186,GO:0007602,GO:0031680,GO:0031681	hsa04014,hsa04062,hsa04151,hsa04371,hsa04713,hsa04723,hsa04724,hsa04725,hsa04726,hsa04727,hsa04728,hsa04926,hsa05032,hsa05034,hsa05163,hsa05167,hsa05170,hsa05200	NA	GSE161529	33950524
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chr17	79576494	79577406	913	*	Intron (ENST00000693108.1/146713, intron 1 of 14)	146713	ENST00000571452.1	26515	RBFOX3	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000381,GO:0003729,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006397,GO:0007399,GO:0008380	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr18	63945237	63945754	357	*	Distal Intergenic	284293	ENST00000408945.5	-3547	HMSD	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0002253,GO:0004867,GO:0005615,GO:0010951	NA	NA	GSE161529	33950524
chr18	64232305	64232754	269	*	Intron (ENST00000589376.1/284294, intron 2 of 9)	400654	ENST00000649058.1	27240	LINC01538	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr18	77882728	77883570	579	*	Distal Intergenic	101927715	ENST00000666771.1	99145	LINC01029	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr18	78431645	78432248	425	*	Distal Intergenic	101927715	ENST00000661306.1	-437914	LINC01029	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr18	78447952	78448703	383	*	Distal Intergenic	101927715	ENST00000661306.1	-454221	LINC01029	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr18	78883586	78885187	346	*	Distal Intergenic	105372224	ENST00000578030.1	33806	LOC105372224	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr18	79767096	79768808	333	*	Distal Intergenic	26251	ENST00000316249.4	-29130	KCNG2	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005249,GO:0005251,GO:0005886,GO:0006813,GO:0008016,GO:0008076,GO:0016021,GO:0034765,GO:0050796,GO:0051260,GO:0070062,GO:0071805	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr19	6646767	6647602	424	*	Distal Intergenic	8740	ENST00000245912.7	22515	TNFSF14	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005102,GO:0005125,GO:0005164,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006915,GO:0006955,GO:0007165,GO:0016021,GO:0031295,GO:0033209,GO:0042098,GO:0042110,GO:0043027,GO:0043029,GO:0043154,GO:0071260,GO:1901224	hsa04060,hsa04061,hsa04064,hsa05168	NA	GSE161529	33950524
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chr22	47865116	47865596	481	*	Intron (ENST00000664761.1/284930, intron 5 of 5)	284930	ENST00000651270.1	165922	LOC284930	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr22	48108692	48109652	285	*	Distal Intergenic	100422916	ENST00000578320.1	-164712	MIR3201	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr22	48150318	48150837	509	*	Distal Intergenic	100422916	ENST00000578320.1	-123527	MIR3201	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr22	49331692	49332281	280	*	Distal Intergenic	348645	ENST00000498829.1	93156	MIR3667HG	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	5475057	5475881	324	*	Distal Intergenic	100616334	ENST00000577799.1	-224802	MIR4790	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	9618696	9620108	379	*	Distal Intergenic	64419	ENST00000353332.9	-29325	MTMR14	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001726,GO:0004438,GO:0004438,GO:0004725,GO:0005515,GO:0005829,GO:0006661,GO:0016236,GO:0035335,GO:0048471	hsa00562,hsa01100,hsa04070,hsa04140	NA	GSE161529	33950524
chr3	10769782	10770188	304	*	Intron (ENST00000440266.2/ENST00000440266.2, intron 1 of 1)	285370	ENST00000664856.1	-5573	LINC00606	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	13737133	13739872	352	*	Intron (ENST00000438915.1/285375, intron 1 of 1)	285375	ENST00000665476.1	86400	LINC00620	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	14628349	14629301	558	*	Intron (ENST00000635800.1/105376960, intron 1 of 2)	51244	ENST00000383794.7	-22461	CCDC174	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr3	42429806	42430222	358	*	Distal Intergenic	131375	ENST00000287748.8	-19196	LYZL4	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001669,GO:0001669,GO:0003796,GO:0005615,GO:0005634,GO:0007342,GO:0009566,GO:0036126,GO:0036126,GO:0042742	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr3	75667719	75668192	373	*	Exon (ENST00000686530.1/ENST00000686530.1, exon 2 of 2)	100288801	ENST00000464571.1	3389	FRG2C	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005634	NA	NA	GSE161529	33950524
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chr3	83635545	83636504	303	*	Distal Intergenic	105377183	ENST00000670186.1	251100	LOC105377183	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	99002449	99003545	496	*	Intron (ENST00000474798.1/105374002, intron 2 of 3)	105374003	ENST00000473756.1	21391	LOC105374003	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	99259564	99260504	304	*	Distal Intergenic	105374005	ENST00000484675.1	266609	LOC105374005	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	104530913	104531380	319	*	Distal Intergenic	214	ENST00000306107.9	-835529	ALCAM	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001772,GO:0002250,GO:0005102,GO:0005515,GO:0005887,GO:0005925,GO:0007155,GO:0007157,GO:0007165,GO:0008045,GO:0009897,GO:0030424,GO:0030425,GO:0031226,GO:0031290,GO:0042101,GO:0042802,GO:0043025,GO:0048846,GO:0070062,GO:1990138	hsa04514	NA	GSE161529	33950524
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chr3	118870604	118871982	269	*	Distal Intergenic	152404	ENST00000459718.1	58271	IGSF11	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005886,GO:0005911,GO:0007156,GO:0014069,GO:0016021,GO:0035255,GO:0040008,GO:0045185,GO:0060076,GO:0061885,GO:1900273	hsa04514	NA	GSE161529	33950524
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chr3	146995130	146995529	294	*	Intron (ENST00000473299.1/ENST00000473299.1, intron 3 of 5)	101927866	ENST00000471638.1	73167	LINC02010	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	168318832	168319296	294	*	Intron (ENST00000502778.5/93556, intron 2 of 2)	93556	ENST00000431685.2	68891	EGFEM1P	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr3	169672717	169675360	575	*	Distal Intergenic	2122	ENST00000486748.2	-8942	MECOM	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000118,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006357,GO:0006915,GO:0016607,GO:0030154,GO:0043069,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045944,GO:0046329,GO:0046872,GO:0046974,GO:0051567,GO:0051726,GO:0070828,GO:0071425	hsa00310,hsa01100,hsa04010,hsa05200,hsa05220	NA	GSE161529	33950524
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chr4	805699	806355	569	*	Promoter (<=1kb)	10815	ENST00000504062.1	-791	CPLX1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000149,GO:0005326,GO:0005515,GO:0005829,GO:0006887,GO:0007268,GO:0007269,GO:0014047,GO:0016079,GO:0017075,GO:0017157,GO:0030073,GO:0030425,GO:0031201,GO:0031630,GO:0043195,GO:0043204,GO:0044305,GO:0046928,GO:0070032,GO:0070554,GO:0098685,GO:0098794,GO:0098967,GO:0098978	hsa04721	NA	GSE161529	33950524
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chr4	3666717	3667933	430	*	Distal Intergenic	100133461	ENST00000508619.1	9922	LINC02171	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chr4	3849803	3850836	274	*	Distal Intergenic	152	ENST00000330055.7	83418	ADRA2C	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0004930,GO:0004938,GO:0004938,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007186,GO:0007267,GO:0007565,GO:0010700,GO:0010700,GO:0030168,GO:0031694,GO:0032148,GO:0032811,GO:0035624,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043025,GO:0043410,GO:0043679,GO:0045666,GO:0045907,GO:0046982,GO:0050796,GO:0051379,GO:0051379,GO:0051930,GO:0070473,GO:0071875,GO:0071880,GO:0098978,GO:0099061	hsa04022,hsa04080	NA	GSE161529	33950524
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chr4	6507305	6507775	357	*	Intron (ENST00000506140.5/5522, intron 2 of 9)	5522	ENST00000314348.12	15772	PPP2R2C	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000159,GO:0000159,GO:0005515,GO:0005829,GO:0019888,GO:0019888,GO:0043666,GO:0070262	hsa03015,hsa04071,hsa04151,hsa04152,hsa04261,hsa04390,hsa04530,hsa04728,hsa05142,hsa05160,hsa05165	NA	GSE161529	33950524
chr4	7644048	7644896	663	*	Intron (ENST00000507866.6/57537, intron 4 of 26)	57537	ENST00000505529.1	-89384	SORCS2	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005887,GO:0006886,GO:0007218,GO:0008188,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030659,GO:0031901,GO:0043197,GO:0043204,GO:0055038,GO:0060292,GO:0098839	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	20540548	20545021	574	*	Distal Intergenic	6197	ENST00000643402.1	-273029	RPS6KA3	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000287,GO:0001501,GO:0002224,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004711,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006915,GO:0007049,GO:0007165,GO:0007417,GO:0018105,GO:0018105,GO:0019901,GO:0030307,GO:0032496,GO:0035556,GO:0043027,GO:0043066,GO:0043154,GO:0043555,GO:0043620,GO:0045597,GO:0045944,GO:0106310,GO:0106311	hsa04010,hsa04114,hsa04150,hsa04714,hsa04720,hsa04722,hsa04914,hsa04931,hsa05135	NA	GSE161529	33950524
chrX	20587595	20590088	346	*	Distal Intergenic	6197	ENST00000643402.1	-320076	RPS6KA3	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0000287,GO:0001501,GO:0002224,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004711,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006915,GO:0007049,GO:0007165,GO:0007417,GO:0018105,GO:0018105,GO:0019901,GO:0030307,GO:0032496,GO:0035556,GO:0043027,GO:0043066,GO:0043154,GO:0043555,GO:0043620,GO:0045597,GO:0045944,GO:0106310,GO:0106311	hsa04010,hsa04114,hsa04150,hsa04714,hsa04720,hsa04722,hsa04914,hsa04931,hsa05135	NA	GSE161529	33950524
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chrX	22606548	22606986	344	*	Intron (ENST00000687248.1/100873065, intron 4 of 5)	158506	ENST00000323684.4	333635	CBLL2	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005737,GO:0016567,GO:0016567,GO:0030155,GO:0046872,GO:0061630	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	22620072	22620423	287	*	Intron (ENST00000687248.1/100873065, intron 4 of 5)	158506	ENST00000323684.4	347159	CBLL2	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005737,GO:0016567,GO:0016567,GO:0030155,GO:0046872,GO:0061630	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	22656559	22658316	335	*	Intron (ENST00000687248.1/100873065, intron 4 of 5)	168400	ENST00000327968.7	-341644	DDX53	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003723,GO:0003724,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005829,GO:0043231	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	23182731	23183328	598	*	Intron (ENST00000687248.1/100873065, intron 2 of 5)	100873065	ENST00000687248.1	109818	PTCHD1-AS	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	23453157	23453867	306	*	Distal Intergenic	139411	ENST00000456522.1	118088	PTCHD1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003674,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007224,GO:0007268,GO:0007614,GO:0007616,GO:0016020,GO:0016021,GO:0021794,GO:0035176,GO:0045202,GO:0050890,GO:0050890,GO:0098976,GO:0098977	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	57082774	57083535	762	*	Distal Intergenic	474343	ENST00000460948.1	37055	SPIN2B	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006915,GO:0007049,GO:0007276,GO:0035064,GO:0035064,GO:0051726	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	57091515	57092038	334	*	Distal Intergenic	474343	ENST00000460948.1	28552	SPIN2B	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006915,GO:0007049,GO:0007276,GO:0035064,GO:0035064,GO:0051726	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	57195197	57195820	525	*	Distal Intergenic	54466	ENST00000614076.1	-57674	SPIN2A	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006355,GO:0007049,GO:0007276,GO:0035064,GO:0035064,GO:0051726	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	57620347	57625826	758	*	Distal Intergenic	158586	ENST00000374888.3	28336	ZXDB	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003674,GO:0003712,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0008150,GO:0046872	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	62888817	62889134	269	*	Distal Intergenic	100874033	ENST00000451979.1	-460512	SPIN4-AS1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	62942574	62944396	1447	*	Distal Intergenic	100874033	ENST00000451979.1	-405250	SPIN4-AS1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	63603202	63606133	317	*	Distal Intergenic	23229	ENST00000636145.1	37915	ARHGEF9	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007186,GO:0014069,GO:0043065,GO:0050790,GO:0051056	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	63818478	63818868	391	*	Distal Intergenic	23229	ENST00000623417.3	-9204	ARHGEF9	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007186,GO:0014069,GO:0043065,GO:0050790,GO:0051056	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	63826281	63828101	277	*	Distal Intergenic	23229	ENST00000623417.3	-17007	ARHGEF9	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007186,GO:0014069,GO:0043065,GO:0050790,GO:0051056	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	75246847	75247714	437	*	Intron (ENST00000652605.1/139596, intron 4 of 13)	139596	ENST00000531704.5	-26371	UPRT	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005515,GO:0005525,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006222,GO:0007565,GO:0007595,GO:0009116,GO:0016310,GO:0032868,GO:0043231	hsa00240,hsa01100	NA	GSE161529	33950524
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chrX	88666018	88666984	967	*	Distal Intergenic	53336	ENST00000276127.9	-80241	CPXCR1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	88667421	88668484	570	*	Distal Intergenic	53336	ENST00000276127.9	-78741	CPXCR1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
chrX	88667531	88668572	501	*	Distal Intergenic	53336	ENST00000276127.9	-78653	CPXCR1	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	NA	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	91389022	91389568	360	*	Distal Intergenic	140886	ENST00000373105.1	-45027	PABPC5	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0003723,GO:0003730,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005759,GO:0005829,GO:0008143,GO:0008266,GO:0010494,GO:1990904	hsa03013,hsa03015,hsa03018	NA	GSE161529	33950524
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chrX	91738234	91738656	423	*	Distal Intergenic	27328	ENST00000298274.12	-40605	PCDH11X	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005509,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0010923	NA	NA	GSE161529	33950524
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chrX	109077529	109078107	364	*	Distal Intergenic	8471	ENST00000372129.4	-340966	IRS4	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005158,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007165,GO:0008286,GO:0043548	hsa04022,hsa04068,hsa04140,hsa04152,hsa04211,hsa04213,hsa04910,hsa04920,hsa04923,hsa04930,hsa04935,hsa05010	NA	GSE161529	33950524
chrX	109100963	109102460	620	*	Distal Intergenic	8471	ENST00000372129.4	-364400	IRS4	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0005158,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007165,GO:0008286,GO:0043548	hsa04022,hsa04068,hsa04140,hsa04152,hsa04211,hsa04213,hsa04910,hsa04920,hsa04923,hsa04930,hsa04935,hsa05010	NA	GSE161529	33950524
chrX	109204089	109205051	291	*	Distal Intergenic	2986	ENST00000218006.3	277035	GUCY2F	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0001653,GO:0004383,GO:0004672,GO:0005524,GO:0005525,GO:0005640,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006182,GO:0006468,GO:0007165,GO:0007168,GO:0007601,GO:0019934,GO:0022400,GO:0038023,GO:0042802,GO:0044877,GO:0050908,GO:0097381,GO:0120200	hsa00230,hsa01100,hsa04744	NA	GSE161529	33950524
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chrX	151949245	151950294	1050	*	Distal Intergenic	2564	ENST00000489333.1	5541	GABRE	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0004890,GO:0005237,GO:0005254,GO:0005887,GO:0007165,GO:0007214,GO:0007268,GO:0008503,GO:0022851,GO:0022851,GO:0030594,GO:0032590,GO:0034220,GO:0034707,GO:0042391,GO:0043005,GO:0045202,GO:0045211,GO:0050877,GO:0051932,GO:0060078,GO:0098794,GO:1902476,GO:1902711,GO:1902711,GO:1904315,GO:2001226	hsa04080,hsa04723,hsa04727,hsa05032,hsa05033	NA	GSE161529	33950524
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chrX	155968501	155969425	333	*	Distal Intergenic	3581	ENST00000244174.11	-28271	IL9R	breast epithelium	h3k27me3&h3k9me3	NA	GO:0004919,GO:0005615,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007165,GO:0038113,GO:0042127	hsa04060,hsa04630,hsa04640	NA	GSE161529	33950524